当气相色谱仪的分流比较大时，有利于色谱峰的形状，但样品分流畸变严重。在实际操作中，应根据样品浓度选择合适的分流比来确定进样量。在不需要气相色谱分析结果的情况下，各方面选择较大的分流比是有利的。

　　另外，随着温度的变化，分流比也会影响针阀的流量特性。因此，气相色谱仪分流比的计算或分流阀的重新调整须在色谱柱和分流进样器温度恒定后进行。操作人员在使用气相色谱仪的色谱工作站后，可以将用于检测不同样品的各种仪器参数作为方法文件存储在计算机中。
　　在此之前，色谱主机的操作参数只能在气相色谱仪上手动设置。色谱工作站提高了仪器的工作效率，使人机界面更加简洁友好。实现计算机的计数器控制后，即可取消气相色谱仪上的控制面板，完全由计算机控制仪器各组成部分的操作参数。
　　为了除去各种气体中可能含有的水分、灰分和有机气体成分，气体在进入仪器前应经过严格的净化。目前，国内气相色谱仪发展技术较高，一般配备分子筛或活性炭过滤净化装置，基本可以满足气相色谱仪的要求。如果使用高纯度气体，在使用前需要净化和过滤。